建国初，由于苏南为新解放区、苏北为老解放区，并未成立江苏省，而是分为了直辖市南京市及苏南、苏北两个行署区，此外还有部分地区隶属于山东、安徽两省。
当时，今江苏境内曾有三个特殊的行政区，分别为一个特区、一个办事处、一个盐区。
其中，苏南行署区辖一个办事处，苏北行署区辖一个盐区，此外当时为山东省所辖部分有一特区。
太湖行政办事处是苏南解放后，为解决太湖水患问题而设的一个县级行政区，管辖所有太湖水面，原属湖州的太湖水域也是这一时期划归的江苏。
太湖行政办事处年7月就已成立，隶属于苏南行署区苏州分区（专区），后曾短暂撤销，到年3月改设为震泽县，隶属于江苏省苏州专区。震泽县年撤销。
淮北盐区是年设立的县级行政区，由苏北行署区直辖。年江苏省成立后，淮北盐区隶属于江苏省徐州专区，4月划入新海连市（县级市），后划入响水县，现为今盐城市响水县陈家港镇。
连云港现在是江苏十三地级市之一，在战争时期是山东根据地、解放区的一部分，年底成立了新海连特区，新中国成立时新海连特区隶属于山东省鲁中南行政区，辖新海市、连云市及云台办事处，是一个专区级行政机构。
此外，苏南行署区还曾辖有一个县级特区。年7月，嵊泗列岛解放后设为县级嵊泗列岛特区，隶属于苏南行署区松江专区，年3月改设为嵊泗县。年6月，嵊泗县划归浙江省舟山专区，相当于与浙江交换了太湖水面。